«Сибирский философский журнал» был основан в 2003 году как журнал «Вестник НГУ. Серия: Философия и право» (гл. ред. – В.С. Диев), как один из значимых элементов формирования профессиональных сообществ философского и юридического факультетов НГУ, а также – позиционирования НГУ в данных предметных областях в российском и международном научном сообществе. В 2006 году журнал разделился на два: «Вестник НГУ. Серия: Философия» (гл. ред. – В.С. Диев, ISSN 1818-796X) и «Вестник НГУ. Серия: Право» (гл. ред. – В.С. Курчеев, ISSN 1818-7986). В 2015 году, в том числе, в связи с переименованием и изменением структуры НГУ, журнал «Вестник НГУ. Серия: Философия» был переименован в «Сибирский философский журнал» (гл. ред. – В.С. Диев, ISSN 2541-7517).